Bindings for protocols::kinematic_closure::pivot_pickers namespace

Classes
		builtins.object PivotPicker EndToEndPivots FixedOffsetPivots FixedPivots LoopPivots StandardPivots   class EndToEndPivots(PivotPicker)     Pick pivots that span the entire loop to sample.     Method resolution order: EndToEndPivots PivotPicker builtins.object Methods defined here: __init__(...) from builtins.PyCapsule __init__(handle) -> NoneType __new__(*args, **kwargs) from builtins.type Create and return a new object.  See help(type) for accurate signature. get_name(...) from builtins.PyCapsule get_name(rosetta.protocols.kinematic_closure.pivot_pickers.EndToEndPivots) -> str   PivotPicker::get_name pick(...) from builtins.PyCapsule pick(self : rosetta.protocols.kinematic_closure.pivot_pickers.EndToEndPivots, pose : rosetta.core.pose.Pose, loop : rosetta.protocols.loops.Loop) -> rosetta.protocols.loops.Loop   PivotPicker::pick   class FixedOffsetPivots(PivotPicker)     Randomly pick pivots which are always offset by the same amount, but which can appear anywhere in the loop.     Method resolution order: FixedOffsetPivots PivotPicker builtins.object Methods defined here: __init__(...) from builtins.PyCapsule __init__(*args, **kwargs) Overloaded function.   1. __init__(handle) -> NoneType   doc   2. __init__(self : handle, offset : int) -> NoneType __new__(*args, **kwargs) from builtins.type Create and return a new object.  See help(type) for accurate signature. get_name(...) from builtins.PyCapsule get_name(rosetta.protocols.kinematic_closure.pivot_pickers.FixedOffsetPivots) -> str   PivotPicker::get_name pick(...) from builtins.PyCapsule pick(self : rosetta.protocols.kinematic_closure.pivot_pickers.FixedOffsetPivots, pose : rosetta.core.pose.Pose, loop : rosetta.protocols.loops.Loop) -> rosetta.protocols.loops.Loop   PivotPicker::pick   class FixedPivots(PivotPicker)     Use a fixed set of pivots specified in advance.     The pivots are specified in the constructor.  Make sure that the pivots will always be contained in the loop being sampled, otherwise strange behavior may occur.     Method resolution order: FixedPivots PivotPicker builtins.object Methods defined here: __init__(...) from builtins.PyCapsule __init__(self : handle, start : int, stop : int, cut : int) -> NoneType __new__(*args, **kwargs) from builtins.type Create and return a new object.  See help(type) for accurate signature. get_name(...) from builtins.PyCapsule get_name(rosetta.protocols.kinematic_closure.pivot_pickers.FixedPivots) -> str   PivotPicker::get_name pick(...) from builtins.PyCapsule pick(self : rosetta.protocols.kinematic_closure.pivot_pickers.FixedPivots, pose : rosetta.core.pose.Pose, loop : rosetta.protocols.loops.Loop) -> rosetta.protocols.loops.Loop   PivotPicker::pick   class LoopPivots(PivotPicker)     Use the start, stop, and cut points of the given loop as pivots.     This algorithm is meant to be simple and intuitive.  The pick() method will be passed a loop, and the pivots will be taken from the parameters of that loop.  If the cut point is outside the loop (e.g. if it hasn't been set), the midpoint of the loop will be used instead.     Method resolution order: LoopPivots PivotPicker builtins.object Methods defined here: __init__(...) from builtins.PyCapsule __init__(handle) -> NoneType __new__(*args, **kwargs) from builtins.type Create and return a new object.  See help(type) for accurate signature. get_name(...) from builtins.PyCapsule get_name(rosetta.protocols.kinematic_closure.pivot_pickers.LoopPivots) -> str   PivotPicker::get_name pick(...) from builtins.PyCapsule pick(self : rosetta.protocols.kinematic_closure.pivot_pickers.LoopPivots, pose : rosetta.core.pose.Pose, loop : rosetta.protocols.loops.Loop) -> rosetta.protocols.loops.Loop   PivotPicker::pick   class PivotPicker(builtins.object)     Base class for all the pivot picking algorithms.     Methods defined here: __init__(...) from builtins.PyCapsule __init__(rosetta.protocols.kinematic_closure.pivot_pickers.PivotPicker) -> NoneType __new__(*args, **kwargs) from builtins.type Create and return a new object.  See help(type) for accurate signature. get_name(...) from builtins.PyCapsule get_name(rosetta.protocols.kinematic_closure.pivot_pickers.PivotPicker) -> str   Return the name of this pivot picker. pick(...) from builtins.PyCapsule pick(self : rosetta.protocols.kinematic_closure.pivot_pickers.PivotPicker, pose : rosetta.core.pose.Pose, loop : rosetta.protocols.loops.Loop) -> rosetta.protocols.loops.Loop   Return a loop object.  The pivots will be taken to be the start,  cut and stop residues.   class StandardPivots(PivotPicker)     Randomly pick pivots in a way that may or may not span the whole loop.     This is the default pivot picking algorithm used by samplers::KicMover.  It works well for most applications, and should only really need to be swapped out in in favor of custom pivot pickers that take into account specific knowledge of the loop being sampled.  Earlier versions of this algorithm were biased towards the fount half of the loop. This bias has been mitigated, but not completely removed, in the current version.     Method resolution order: StandardPivots PivotPicker builtins.object Methods defined here: __init__(...) from builtins.PyCapsule __init__(handle) -> NoneType __new__(*args, **kwargs) from builtins.type Create and return a new object.  See help(type) for accurate signature. get_name(...) from builtins.PyCapsule get_name(rosetta.protocols.kinematic_closure.pivot_pickers.StandardPivots) -> str   PivotPicker::get_name pick(...) from builtins.PyCapsule pick(self : rosetta.protocols.kinematic_closure.pivot_pickers.StandardPivots, pose : rosetta.core.pose.Pose, loop : rosetta.protocols.loops.Loop) -> rosetta.protocols.loops.Loop   PivotPicker::pick