rosetta.protocols.toolbox.rigid_body
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(built-in)

Bindings for protocols::toolbox::rigid_body namespace

 
Functions
       
create_euler_rotation(...) method of builtins.PyCapsule instance
create_euler_rotation(*args, **kwargs)
Overloaded function.
 
1. create_euler_rotation(M : rosetta.numeric.xyzMatrix_double_t, alpha : float, beta : float, gamma : float,  : rosetta.numeric.xyzVector_double_t, axis2 : rosetta.numeric.xyzVector_double_t, axis3 : rosetta.numeric.xyzVector_double_t) -> NoneType
 
2. create_euler_rotation(M : rosetta.numeric.xyzMatrix_double_t, alpha : float, beta : float, gamma : float) -> NoneType
figure_out_moving_partition_res(...) method of builtins.PyCapsule instance
figure_out_moving_partition_res(pose : rosetta.core.pose.Pose, moving_res : int, reference_res : int) -> rosetta.utility.vector1_unsigned_long
figure_out_reference_res_for_jump(...) method of builtins.PyCapsule instance
figure_out_reference_res_for_jump(pose : rosetta.core.pose.Pose, moving_res : int) -> int
 
//////////////////////////////////////////////////////////
get_atom_coordinates(...) method of builtins.PyCapsule instance
get_atom_coordinates(xyz_list : rosetta.utility.vector1_std_pair_core_id_AtomID_numeric_xyzVector_double_t, seq_num : int, rsd_at_origin : rosetta.core.conformation.Residue, moving_res_base_stub : rosetta.core.kinematics.Stub) -> NoneType
get_base_centroid_and_rotation_matrix(...) method of builtins.PyCapsule instance
get_base_centroid_and_rotation_matrix(pose : rosetta.core.pose.Pose, i : int, centroid : rosetta.numeric.xyzVector_double_t, M : rosetta.numeric.xyzMatrix_double_t) -> NoneType
get_euler_angles(...) method of builtins.PyCapsule instance
get_euler_angles(*args, **kwargs)
Overloaded function.
 
1. get_euler_angles(alpha : float, beta : float, gamma : float, M1 : rosetta.numeric.xyzMatrix_double_t, M2 : rosetta.numeric.xyzMatrix_double_t) -> NoneType
 
//////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 
2. get_euler_angles(alpha : float, beta : float, gamma : float, M1 : rosetta.numeric.xyzMatrix_double_t, M2 : rosetta.numeric.xyzMatrix_double_t, verbose : bool) -> NoneType
 
//////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
get_specific_atom_coordinate(...) method of builtins.PyCapsule instance
get_specific_atom_coordinate(*args, **kwargs)
Overloaded function.
 
1. get_specific_atom_coordinate(atom_pos : rosetta.numeric.xyzVector_double_t, moving_res_base_stub : rosetta.core.kinematics.Stub) -> NoneType
 
2. get_specific_atom_coordinate(atom_index : int, atom_pos : rosetta.numeric.xyzVector_double_t, rsd_at_origin : rosetta.core.conformation.Residue, moving_res_base_stub : rosetta.core.kinematics.Stub) -> NoneType
 
3. get_specific_atom_coordinate(atom_name : str, atom_pos : rosetta.numeric.xyzVector_double_t, rsd_at_origin : rosetta.core.conformation.Residue, moving_res_base_stub : rosetta.core.kinematics.Stub) -> NoneType
initialize_stub(...) method of builtins.PyCapsule instance
initialize_stub(rsd : rosetta.core.conformation.Residue) -> rosetta.core.kinematics.Stub
rotate(...) method of builtins.PyCapsule instance
rotate(*args, **kwargs)
Overloaded function.
 
1. rotate(pose : rosetta.core.pose.Pose, M : rosetta.numeric.xyzMatrix_double_t, ref_pose : rosetta.core.pose.Pose, moving_res : rosetta.utility.vector1_unsigned_long, centroid : rosetta.numeric.xyzVector_double_t) -> NoneType
 
2. rotate(pose : rosetta.core.pose.Pose, M : rosetta.numeric.xyzMatrix_double_t, ref_pose : rosetta.core.pose.Pose, moving_res : rosetta.utility.vector1_unsigned_long) -> NoneType
set_to_origin(...) method of builtins.PyCapsule instance
set_to_origin(pose : rosetta.core.pose.Pose, seq_num : int, verbose : bool) -> NoneType
transform_moving_partition_to_origin(...) method of builtins.PyCapsule instance
transform_moving_partition_to_origin(pose_start : rosetta.core.pose.Pose, moving_res : int, moving_partition_res_ : rosetta.utility.vector1_unsigned_long) -> rosetta.core.pose.Pose
translate(...) method of builtins.PyCapsule instance
translate(pose : rosetta.core.pose.Pose, shift : rosetta.numeric.xyzVector_double_t, ref_pose : rosetta.core.pose.Pose, moving_res : rosetta.utility.vector1_unsigned_long) -> NoneType
translate_and_rotate_residue_to_origin(...) method of builtins.PyCapsule instance
translate_and_rotate_residue_to_origin(*args, **kwargs)
Overloaded function.
 
1. translate_and_rotate_residue_to_origin(pose : rosetta.core.pose.Pose, i : int, moving_res : rosetta.utility.vector1_unsigned_long) -> NoneType
 
2. translate_and_rotate_residue_to_origin(pose : rosetta.core.pose.Pose, i : int, moving_res : rosetta.utility.vector1_unsigned_long, do_not_rotate : bool) -> NoneType
 
3. translate_and_rotate_residue_to_origin(pose : rosetta.core.pose.Pose, i : int) -> NoneType