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Functions
		ALPHA(...) method of builtins.PyCapsule instance ALPHA(r0 : float, omega0 : float, P_omega0 : float) -> float   Calculates alpha, the tilt angle of the minor helix. COSFXN(...) method of builtins.PyCapsule instance COSFXN(t : float, omega : float, delta_omega : float) -> float   Calculates cos(omega*t+delta_omega) PP(...) method of builtins.PyCapsule instance PP(r0 : float, omega0 : float, z1 : float, failed : bool) -> float   Calculates P, the repeat distance of the major helix in the z-direction.      Sets "failed" to TRUE if and only if the value of P could not be calculated. P_omega0(...) method of builtins.PyCapsule instance P_omega0(r0 : float, omega0 : float, z1 : float, failed : bool) -> float   Calculates P*omega0 (the repeat distance of the major helix in the z-direction times the major helix  turn per residue).      Sets "failed" to TRUE if and only if the value of P*omega0 could not be calculated. SINFXN(...) method of builtins.PyCapsule instance SINFXN(t : float, omega : float, delta_omega : float) -> float   Calculates sin(omega*t+delta_omega) XYZ_BUNDLE(...) method of builtins.PyCapsule instance XYZ_BUNDLE(t : float, r0 : float, omega0 : float, delta_omega0 : float, r1 : float, omega1 : float, z1 : float, delta_omega1 : float, delta_z1 : float, failed : bool) -> rosetta.numeric.xyzVector_double_t   Calculate the x,y,z coordinates of a point on the helix of  helices given the Crick parameters for the bundle.      Not quite as efficient as it could be, but it probably  doesn't matter.  (If I really wanted to optimize this, I'd make sure  that c0, c1, s0, s1, and alpha were all calculated once rather than  thrice.)  Returns failed=true if calculation fails, failed=false otherwise. X_BUNDLE(...) method of builtins.PyCapsule instance X_BUNDLE(t : float, r0 : float, omega0 : float, delta_omega0 : float, r1 : float, omega1 : float, z1 : float, delta_omega1 : float, delta_z1 : float, failed : bool) -> float   Calculates the x-position on the helix of helices  given the Crick parameters for the bundle.      Returns failed=true if calculation fails, failed=false otherwise. Y_BUNDLE(...) method of builtins.PyCapsule instance Y_BUNDLE(t : float, r0 : float, omega0 : float, delta_omega0 : float, r1 : float, omega1 : float, z1 : float, delta_omega1 : float, delta_z1 : float, failed : bool) -> float   Calculates the x-position on the helix of helices  given the Crick parameters for the bundle.      Returns failed=true if calculation fails, failed=false otherwise. Z_BUNDLE(...) method of builtins.PyCapsule instance Z_BUNDLE(t : float, r0 : float, omega0 : float, delta_omega0 : float, r1 : float, omega1 : float, z1 : float, delta_omega1 : float, delta_z1 : float, failed : bool) -> float   Calculates the x-position on the helix of helices  given the Crick parameters for the bundle.      Returns failed=true if calculation fails, failed=false otherwise. dx_ddelta_omega1(...) method of builtins.PyCapsule instance dx_ddelta_omega1(r1 : float, omega1 : float, t : float, dz1 : float, delta_omega1 : float, delta_z1 : float) -> float   Returns the derivative of x with respect to delta_omega1 (omega-offset) for a given value of r1, omega1, and t.  Note that this is not translated or rotated. dx_ddelta_z1(...) method of builtins.PyCapsule instance dx_ddelta_z1(r1 : float, omega1 : float, t : float, dz1 : float, delta_omega1 : float, delta_z1 : float) -> float   Returns the derivative of x with respect to delta_z1 (z-offset) for a given value of r1, omega1, and t.  Note that this is not translated or rotated. dx_ddz1(...) method of builtins.PyCapsule instance dx_ddz1(r1 : float, omega1 : float, t : float, dz1 : float, delta_omega1 : float, delta_z1 : float) -> float   Returns the derivative of x with respect to dz1 (rise per residue) for a given value of r1, omega1, and t.  Note that this is not translated or rotated. dx_domega1(...) method of builtins.PyCapsule instance dx_domega1(r1 : float, omega1 : float, t : float, dz1 : float, delta_omega1 : float, delta_z1 : float) -> float   Returns the derivative of x with respect to omega1 for a given value of r1, omega1, and t.  Note that this is not translated or rotated. dx_dr1(...) method of builtins.PyCapsule instance dx_dr1(r1 : float, omega1 : float, t : float, dz1 : float, delta_omega1 : float, delta_z1 : float) -> float   Returns the derivative of x with respect to r1 for a given value of r1, omega1, and t.  Note that this is not translated or rotated. dy_ddelta_omega1(...) method of builtins.PyCapsule instance dy_ddelta_omega1(r1 : float, omega1 : float, t : float, dz1 : float, delta_omega1 : float, delta_z1 : float) -> float   Returns the derivative of y with respect to delta_omega1 (omega-offset) for a given value of r1, omega1, and t.  Note that this is not translated or rotated. dy_ddelta_z1(...) method of builtins.PyCapsule instance dy_ddelta_z1(r1 : float, omega1 : float, t : float, dz1 : float, delta_omega1 : float, delta_z1 : float) -> float   Returns the derivative of y with respect to delta_z1 (z-offset) for a given value of r1, omega1, and t.  Note that this is not translated or rotated. dy_ddz1(...) method of builtins.PyCapsule instance dy_ddz1(r1 : float, omega1 : float, t : float, dz1 : float, delta_omega1 : float, delta_z1 : float) -> float   Returns the derivative of y with respect to dz1 (rise per residue) for a given value of r1, omega1, and t.  Note that this is not translated or rotated. dy_domega1(...) method of builtins.PyCapsule instance dy_domega1(r1 : float, omega1 : float, t : float, dz1 : float, delta_omega1 : float, delta_z1 : float) -> float   Returns the derivative of y with respect to omega1 for a given value of r1, omega1, and t.  Note that this is not translated or rotated. dy_dr1(...) method of builtins.PyCapsule instance dy_dr1(r1 : float, omega1 : float, t : float, dz1 : float, delta_omega1 : float, delta_z1 : float) -> float   Returns the derivative of y with respect to r1 for a given value of r1, omega1, and t.  Note that this is not translated or rotated. dz_ddelta_omega1(...) method of builtins.PyCapsule instance dz_ddelta_omega1(r1 : float, omega1 : float, t : float, dz1 : float, delta_omega1 : float, delta_z1 : float) -> float   Returns the derivative of z with respect to delta_omega1 (omega-offset) for a given value of r1, omega1, and t.  Note that this is not translated or rotated. dz_ddelta_z1(...) method of builtins.PyCapsule instance dz_ddelta_z1(r1 : float, omega1 : float, t : float, dz1 : float, delta_omega1 : float, delta_z1 : float) -> float   Returns the derivative of z with respect to delta_z1 (z-offset) for a given value of r1, omega1, and t.  Note that this is not translated or rotated. dz_ddz1(...) method of builtins.PyCapsule instance dz_ddz1(r1 : float, omega1 : float, t : float, dz1 : float, delta_omega1 : float, delta_z1 : float) -> float   Returns the derivative of z with respect to dz1 (rise per residue) for a given value of r1, omega1, and t.  Note that this is not translated or rotated. dz_domega1(...) method of builtins.PyCapsule instance dz_domega1(r1 : float, omega1 : float, t : float, dz1 : float, delta_omega1 : float, delta_z1 : float) -> float   Returns the derivative of z with respect to omega1 for a given value of r1, omega1, and t.  Note that this is not translated or rotated. dz_dr1(...) method of builtins.PyCapsule instance dz_dr1(r1 : float, omega1 : float, t : float, dz1 : float, delta_omega1 : float, delta_z1 : float) -> float   Returns the derivative of z with respect to r1 for a given value of r1, omega1, and t.  Note that this is not translated or rotated. gradnorm(...) method of builtins.PyCapsule instance gradnorm(r0 : float, omega0 : float, Pomega0 : float, s0 : float, c0 : float) -> float   Calculates the norm of the gradient vector      Needed for adding the small delta_z1 offsets, which are in the direction  of (dx/dt, dy/dt, dz/dt) of the major helix. x(...) method of builtins.PyCapsule instance x(r1 : float, omega1 : float, t : float, dz1 : float, delta_omega1 : float, delta_z1 : float) -> float   Returns the x-coordinate of a point on a helix given r1, omega1, and t.  Note that this is not translated or rotated. xyz(...) method of builtins.PyCapsule instance xyz(r1 : float, omega1 : float, t : float, dz1 : float, delta_omega1 : float, delta_z1 : float) -> rosetta.numeric.xyzVector_double_t   Returns the x-, y-, and z-coordinates of a point on a helix given r1, omega1, and t.  Note that this is not translated or rotated. y(...) method of builtins.PyCapsule instance y(r1 : float, omega1 : float, t : float, dz1 : float, delta_omega1 : float, delta_z1 : float) -> float   Returns the y-coordinate of a point on a helix given r1, omega1, and t.  Note that this is not translated or rotated. z(...) method of builtins.PyCapsule instance z(r1 : float, omega1 : float, t : float, dz1 : float, delta_omega1 : float, delta_z1 : float) -> float   Returns the z-coordinate of a point on a helix given r1, omega1, and t.  Note that this is not translated or rotated.