rosetta.core.io.carbohydrates
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(built-in)

Bindings for core::io::carbohydrates namespace

 
Functions
       
chain_gws_string(...) method of builtins.PyCapsule instance
chain_gws_string(pose : rosetta.core.pose.Pose, chain_id : int) -> str
 
Return a GWS-formatted string for the given carbohydrate chain, including branches.
char_to_int(...) method of builtins.PyCapsule instance
char_to_int(char_in : str) -> int
 
Given a char, parse it as an integer.
 
 
 Returns 0 for anything outside of the range 1-9.
 
 
 Vikram K. Mulligan (vmullig.edu).
dump_gws(...) method of builtins.PyCapsule instance
dump_gws(pose : rosetta.core.pose.Pose, filename : str) -> NoneType
 
Write the GlycoWorkbench structure file for all carbohydrate chains of the given pose to <filename>.
dump_gws_chain(...) method of builtins.PyCapsule instance
dump_gws_chain(pose : rosetta.core.pose.Pose, chain_id : int, filename : str) -> NoneType
 
Write the GlycoWorkbench structure file for the given pose chain to <filename>.
residue_gws_string(...) method of builtins.PyCapsule instance
residue_gws_string(pose : rosetta.core.pose.Pose, seqpos : int) -> str
 
Return a GWS-formatted string for the given carbohydrate residue.
residue_range_gws_string(...) method of builtins.PyCapsule instance
residue_range_gws_string(pose : rosetta.core.pose.Pose, begin : int, end : int) -> str
 
Return a GWS-formatted string for each carbohydrate residue in the given sequence range, including branches.
sugar_modifications_from_suffix(...) method of builtins.PyCapsule instance
sugar_modifications_from_suffix(suffix : str) -> rosetta.utility.vector1_std_pair_unsigned_long_std_string_t
 
Parse sugar code suffixes to extract a list of sugar modifications with their corresponding positions.